Franco Farinelli è oltre ad essere borsista di numerose Università europee ha avuto numerosi incarichi accademici sia in Italia che all’estero. In Italia è stato:
Presidente del Consiglio di Corso di Laurea Magistrale in Geografia e Processi Territoriali dell'Università di Bologna, 2004
Direttore del Dipartimento di Discipline della Comunicazione dell'Università di Bologna, 2001-2007
Presidente del Consiglio di Corso di Laurea in Scienze Geografiche dell'Università di Bologna, 2001-2004
Presidente del Consiglio di Corso di Laurea in Scienze della Comunicazione, Università di Bologna, 1998-2000
Direttore dell'Istituto di Geografia dell'Università di Bologna, 1986-93
Professore ordinario di Geografia, Facoltà di Lettere e Filosofia, Università di Bologna, 1985 –
Professore Associato di Geografia, Facoltà di Lettere e Filosofia, Università di Bologna, 1984-1985
Tra i suoi incarichi editoriali ricordiamo:
Editorial Board, Le Globe, 2001
Editorial Board, Rivista Geografica Italiana, 1998-
Direttore, Geotema, 1995-
Editorial board, Metronomie, 1994-2002
Editorial Board, Ecumene, 1993-
Editorial Board, Cahiers de Géographie du Quebec, 1991
